甲状腺疾病必要时可以选择穿刺的方法，进一步明确诊断。每一项医学处置的有创操作，都可能出现并发症或者后遗症，常见的就是穿刺部位的感染，病人会有明显的疼痛，甚至发热，查体局部有明显的炎症反应，必要时需要抗感染治疗。穿刺术后局部可能会疼痛，通常可以耐受，会逐渐减轻。恶性病变穿刺过程中，有可能导致肿瘤细胞种植性转移，但发生率非常低。穿刺过程中也容易导致邻近组织的副损伤，包括神经或者血管的损伤，病人也会出现感觉异常。甲状腺供血是非常丰富的，严重的可能会形成血肿。
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