甲亢术后并发症主要是由于手术损伤，导致永久性甲状旁腺功能减退症和喉返神经损伤，以及局部出血和永久性甲状腺功能减退。甲亢往往通过手术治疗甲状腺肿大明显有压迫症状，或中重度甲亢长期服药没有效果，或停药以后复发，或有些人不能坚持服药。胸骨后甲状腺肿也需要手术治疗，经过细针穿刺细胞学检查怀疑是恶性甲状腺病变，抗甲状腺的药物治疗无效或过敏的妊娠患者，手术往往需要在妊娠4-6个月进行。重度活动性的甲状腺相关眼病不能使用甲状腺手术治疗，合并严重心脏、肝脏、肾脏疾病，不能耐受手术。通常甲亢手术治疗只采取甲状腺次全切除术，两侧各留2-3g甲状腺组织，复发率为8%，甲状腺全切的复发率给予几乎是零。有经验的医生操作时，甲状腺功能亢进手术的并发症发生率不过2%，缺乏经验的医生操作时，发生率未达到10%-15%，甲亢手术治疗有效率往往都在90%以上。
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