女性的月经期是体内雌激素和孕激素水平最低的阶段，这两种激素下降之后，女性生殖系统的防御能力就会下降，并且阴道的自净能力也处于最低阶段。如果此时发生性生活，容易发生细菌感染，经期由于经血流出，宫颈口敞开，细菌有可能沿着宫颈上行感染至盆腔，甚至全身，导致严重的生殖系统感染，引起女性慢性盆腔炎等疾病的发生。另外，经血有一定的繁殖能力，尤其是子宫内膜，脱落的内膜如果在发生性生活时逆流至盆腔，就有可能种植在盆腔其他器官上，比如卵巢、输卵管、盆腔、腹膜等等，这就是常说的子宫内膜异位症，女性可能出现会继发性痛经，并进行性加重，还有可能引起不孕。
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